Numer 28/2022/2023 — 27.03.2023 r.

Wizualiacja struktur białkowych z bazy Protein Data Bank - warsztat SCIENCE

autor: Łukasz Wolański

Jednym z celów warsztatu naukowego Science dla licealistów jest zapoznanie uczniów z prężnie rozwijającymi się współcześnie dziedzinami interdyscyplinarnymi. Jedną z nich jest bioinformatyka zajmująca się rozwojem metod obliczeniowych służących do badania i symulacji struktury, funkcji i ewolucji genów, genomów i białek.

Na pierwszych praktycznych zajęciach uczniowie poznali bazę danych Protein Data Bank oraz nauczyli się wizualizować znajdujące się w niej struktury białkowe za pomocą programu VMD (Visual Molecular Dynamics). W zależności od wybranego sposobu reprezentacji, możliwe było analizowanie struktury chemicznej-cząsteczkowej białek, motywów struktury drugorzędowej (helisy itp) oraz struktury trzecio- i czwartorzędowej (obecność wielu podjednostek białka i ich wyróżnianie np. za pomocą kolorów). 

Komentarz lub zgłoszenie tematu




Same cyfry, bez spacji lub kresek

Lokalizacja

ul. Staszica 1
05-800 Pruszków

Redakcja

Adres e-mail: tygodnik@azymut.edu.pl

© 2024 Wszystkie prawa zastrzeżone.